Bioinformatics Workshop - Genome assembly

Workshop bioinformatiky je navržen tak, aby nabídl praktické zkušenosti s analýzou moderních genomických dat, a je otevřen široké vědecké veřejnosti, včetně neakademických pracovníků. V průběhu roku se zabývá různými tématy.

Tématem workshopu 2. února je „Sestavení genomu“ – žijeme v době, kdy nám technologický pokrok umožňuje sestavit kompletní chromozomy, od telomeru k telomeru, včetně dříve nepřístupných oblastí, jako jsou centromery nebo pohlavní chromozomy. Workshop se bude konat na Fakultě informatiky od 8:30 do 12:30 (na požádání lze přidat odpolední blok). Všichni účastníci musí mít základní znalosti bioinformatiky, příkazového řádku a prostředí Linux. Počet účastníků je omezen na 15.

Workshop 2. února bude zahrnovat:

• datové typy potřebné pro sestavení kompletních chromozomů od telomeru k telomeru (T2T)
• algoritmy optimalizované pro sestavení diploidního genomu
• kontrolu kvality sestavení genomu
• práci se sestaveními s rozlišením haplotypů
• úvahy o lidské genomice versus nemodelových organismech
• sekci otázek a odpovědí zaměřenou na dotazy účastníků

Cena: 1000 Kč

Místo konání: A219, počítačová učebna Linux na FI, Botanická 68a

Více informací a registrace zde