Autoři z našeho ústavu, Anna Hýsková, Eva Maršálková a Petr Šimeček publikovali studii porovnávající tři hojně používané nástroje pro predikci proteinových struktur: AlphaFold2, ESMFold a OmegaFold. Na rozsáhlém souboru 1337 proteinů experimentálně charakterizovaných v letech 2022 až 2024 ukázali, že AlphaFold2 dosahuje nejvyšší přesnosti predikcí. Současně však potvrdili, že moderní jazykové modely ESMFold a OmegaFold dokážou produkovat velmi kvalitní výsledky při výrazně nižších výpočetních nárocích.
Studie odhalila i situace, ve kterých rychlejší modely překonávají AlphaFold2, například při predikci de novo navržených proteinů bez evolučních homologů. Autoři navíc vyvinuli model, který dokáže předem odhadnout, kdy se vyplatí investovat výpočetní čas do přesnějšího AlphaFoldu a kdy postačí rychlejší alternativa.
Publikace: Hýsková A., Maršálková E., Šimeček P. Balancing speed and precision in protein folding: a comparison of AlphaFold2, ESMFold, and OmegaFold. Frontiers in Genetics (2026). DOI: https://doi.org/10.3389/fgene.2025.1715037
Ocenění MUNI Scientist za výrazné počiny, publikování v prestižních magazínech či nakladatelstvích a za vynikající výsledky výzkumu si 11. prosince převzalo 37 vědců či výzkumných skupin.
Cílem ocenění interní Grantové agentury Masarykovy univerzity (GAMU) je posílení motivace vědeckých pracovníků univerzity a šíření dobrého jména univerzity ve vědecké komunitě i na veřejnosti. Slavnostního předávání cen se v atriu institutu CEITEC MU osobně zúčastnilo 43 výzkumníků a týmů.
