Vědecké zaměření

​Zaměřujeme se na pochopení molekulárních mechanismů, které jsou základem životně důležitých biologických procesů. Zajímají nás zejména procesy zahrnující biologické membrány, proteiny a jejich interakce. Naším cílem je využít získané poznatky k návrhu nových peptidů/proteinů nebo k modifikaci těch stávajících, které by mohly být užitečné v lékařských nebo biotechnologických aplikacích. Výsledky našich počítačových simulací s pokročilými technikami vzorkování jsou ověřovány experimenty in vitro s využitím fluorescenční mikroskopie, QCM, AFM, mikroskopie a biochemických testů.

Výzkumné oblasti

• Membránově aktivní peptidy (antimikrobiální, pronikající do buněk, protinádorové, antivirové, senzory složení lipidů, induktory zakřivení), remodelace membrán, tvorba pórů, fúze, indukované zakřivení a ztenčení membrán.
• Virová infekce, transkripce, signální dráhy
• Vývoj zhrubených modelů
• Výpočty volné energie

Hlavní cíle

• Vyvinout výpočetní metody, které nám umožní určit vlastnosti peptidů pro zacílení a narušení různých patogenních membrán.
• Poskytnout struktury a dynamiku klíčových procesů během virové infekce, transkripce a buněčné signalizace.
  ​