Strukturní bioinformatika
Vedoucí: doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D.
Vědecké zaměření
Náš výzkum se zaměřuje na analýzu 3D struktury proteinů, jejich fragmentů a celých proteinových rodin. Konkrétně se zabýváme vizualizací, validací, anotací, detekcí fragmentů a charakterizací proteinů a proteinových rodin. Vyvíjíme rovněž softwarové nástroje pro realizaci těchto typů analýz.
Hlavní cíle:
- Vizualizace 1D, 2D a 3D struktury proteinů
- Detekce proteinových tunelů a fragmentů
- Validace struktury proteinů a ligandů
- Výpočet částečných atomových nábojů
- Anotace struktury proteinů a analýza proteinových rodin
Bližší informace o naší skupině najdete na stránkách skupiny.
Členové týmu
Vedoucí podskupin
- RNDr. David Sehnal, Ph.D.
- RNDr. Tomáš Raček, Ph.D.
- Mgr. Vladimír Horský, Ph.D.
Výzkumný pracovník
- Aliaksei Chareshneu, Ph.D.
- Mgr. Veronika Horská, Ph.D.
- RNDr. Ondřej Schindler, Ph.D.
- RNDr. Ivana Hutařová Vařeková, PhD.
PhD student
- Mgr. Bc. Gabriela Bučeková
- Mgr. Viktoriia Doshchenko
- Mgr. Adrián Rošinec
- Mgr. Bc. Jana Porubská
- Mgr. Ing. Tomáš Svoboda
Bc/Mgr student
- Bc. Martin Jediný
- Bc. Kamil Jelínek
- Bc. Michal Oleksik
- Bc. Amálie Švehlová
- Bc. Dominik Tichý
- Bc. Dušan Veľký
- Lukáš Bohuš
- Margarita Marsová